वाणिज्यिक जलीय संस्कृति को स्वास्थ्य और उत्पादक बनाए रखने के लिए निर्मित, विशेष रूप से तैयार और पोषक आहार की आवश्यकता होती है। जबकि सभी जानवरों को खाने की ज़रूरत होती है और सभी खेती वाले जानवरों को खिलाने की ज़रूरत होती है, जलीय कृषि सबसे कुशल विधि का प्रतिनिधित्व करती है जिसके द्वारा फ़ीड को खाद्य प्रोटीन में परिवर्तित किया जा सकता है। एनओएए-यूएसडीए वैकल्पिक फ़ीड पहल के माध्यम से अनुसंधान ने समुद्री भोजन की खपत के महत्वपूर्ण मानव स्वास्थ्य लाभों को बनाए रखते हुए जलीय कृषि फ़ीड में मछली के भोजन और मछली के तेल के उपयोग को कम करने की दिशा में प्रगति तेज कर दी है। विकल्प विकसित करने में उल्लेखनीय प्रगति ने इस उद्देश्य के लिए पकड़ी गई जंगली मछली पर निर्भरता कम कर दी है।