मेडिकल माइक्रोबायोलॉजी प्रतिरक्षा प्रणाली की समीक्षा से शुरू होती है, जिसके द्वारा कोशिकाओं पर विजय पाने और उनका सामना करने के लिए सूक्ष्मजीव या विषाक्त पदार्थ बलपूर्वक प्रवेश करते हैं। यह सूक्ष्मजीवों या रोगाणुओं का अध्ययन है जो हमारे जीवन के हर पहलू को प्रभावित करते हैं और इसमें सूक्ष्मजीवों के प्रति मेजबान प्रतिक्रिया भी शामिल है।
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